Rapide : 8 fois moins de temps de manipulation que les protocoles conventionnels de préparation de librairies 16S.
Facile : la plaque prémélangée minimise le temps de manipulation et les erreurs de manipulation.
Flux de travail simple : 100% prêt pour l'automatisation avec une seule étape de PCR et aucun besoin de normalisation. Il suffit de regrouper les échantillons à volume égal !
DESCRIPTION
Le kit Quick-16S Plus NGS Library Prep Kit (V4) est le plus rapide et le plus simple des kits de préparation de librairies NGS ciblant la région V4 du gène de l'ARNr 16S pour le séquençage à haut débit. Le protocole facile à automatiser utilise une plaque d'amplification prémélangée et une seule qPCR/PCR pour l'amplification ciblée combinée et l'ajout de codes-barres. La mise en commun par volume égal et un seul nettoyage de la librairie finale, plutôt que des nettoyages massifs à base de billes AMPure®, simplifient le processus de préparation de la librairie. Il n'est pas nécessaire de procéder à des analyses supplémentaires de quantification des librairies, telles que l'analyse TapeStation® ou l'électrophorèse sur gel. Grâce à ces caractéristiques, le flux de travail réduit considérablement le temps de préparation des librairies à seulement 30 minutes.
Taille de l'amplicon - La taille finale de l'amplicon après une PCR en une étape (amplification ciblée et ajout d'un code-barres) est de ~388 pb.
Matériel nécessaire (fourni par l'utilisateur) - Microcentrifugeuse, essoreuse de plaques (centrifugeuse), système de PCR quantitative en temps réel à 96 puits (compatible SYBR Green recommandé), ou système de PCR standard, et plaques de PCR en temps réel à 96 puits.
Séquences d'index - Les index de 10 pb sont énumérés dans le modèle de feuille d'échantillons MiSeq fourni.
Échantillon d'entrée - ADN microbien purifié (≤100 ng), exempt d'inhibiteurs de PCR.
Plateforme de séquençage - Compatible avec toutes les plateformes de séquençage Illumina® à l'aide d'amorces de séquençage personnalisées. Nous recommandons le kit de réactifs MiSeq® v2 (300 cycles).
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