Optimisé pour les petits fragments : Idéal pour les petits fragments d'ADN endommagés tels que l'ADN acellulaire (cfDNA).
Appel de méthylation précis : Le protocole basé sur la ligature directe permet des lectures précises et la détermination de la méthylation des extrémités natives de chaque fragment d'ADN.
Flux de travail simple et rationalisé : Préparez des librairies méthyl-seq robustes en seulement 3 étapes.
DESCRIPTION
La trousse Zymo-Seq Cell Free DNA WGBS Library Kit offre un flux de travail optimisé et fiable pour la préparation de librairies de séquençage au bisulfite du génome entier (WGBS) à partir d'ADN acellulaire (cfDNA). Ce kit tout compris présente une procédure simple capable de préparer des librairies de méthyl-séquençage de haute qualité à partir de 5 ng d'ADNcf. Le processus se déroule en trois étapes de base : conversion au bisulfite, ligature directe de l'adaptateur et amplification par PCR indexée.
Le traitement initial au bisulfite est doux pour l'ADNcf mais efficace pour convertir toutes les cytosines non modifiées en uracile. Ensuite, les adaptateurs splinted novateurs capturent et ligaturent directement les adaptateurs compatibles avec Illumina sur des fragments d'ADN de n'importe quelle taille, ce qui permet le séquençage de fragments d'ADN entaillés, endommagés et courts qui auraient pu être rejetés avec les méthodes traditionnelles de préparation de librairies. La ligature directe des adaptateurs élimine également la nécessité de synthétiser un second brin, de réparer l'extrémité et d'effectuer des étapes de tailing dA, réduisant ainsi le biais en préservant l'intégrité de toute méthylation native présente sur les extrémités des fragments. Enfin, le cfDNA lié à l'adaptateur est indexé et amplifié par PCR avec les UDI de Zymo-Seq, générant des librairies prêtes pour le séquençage sur n'importe quel instrument Illumina.
Séquences de codes-barres - Veuillez vous référer à la section Documents.
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