Kit de réactifs à billes magnétiques SMARTer®

pour séquençage d'ARN en cellule uniquede protéines

SMARTer Target RNA Capture for Illumina est un système complet conçu pour générer de l'ADNc à partir d'ARN total enrichi. L'ARN-seq ciblé permet de surmonter plusieurs difficultés inhérentes aux expériences d'amplification du transcriptome entier (WTA), en améliorant la couverture des séquences et la sensibilité de la détection des transcrits d'intérêt qui peuvent être présents en faibles quantités. Les approches RNA-seq ciblées sont également avantageuses car elles permettent de réduire les coûts et de simplifier l'analyse. L'enrichissement des transcrits d'intérêt avant la synthèse de l'ADNc permet d'obtenir des informations sur des transcrits qui pourraient autrement être manqués ou nécessiter un nombre beaucoup plus important de lectures de séquençage pour être détectés, y compris les fusions de gènes chimériques, les isoformes de transcrits et les variantes d'épissage. En améliorant la sensibilité, la puissance de l'analyse est également améliorée, comme le montre la réduction du rapport signal/bruit. Dans le flux de travail SMARTer Target RNA Capture for Illumina, l'ARN total est hybridé avec des sondes ADN biotinylées conçues par l'utilisateur en moins de quatre heures, puis purifié avant d'être capturé sur des billes de capture - des particules magnétiques enduites de streptavidine. Les billes de capture ont été sélectionnées parce qu'elles présentent une adsorption particulièrement faible des protéines et des acides nucléiques et qu'elles n'interfèrent pas avec les réactions en aval telles que la PCR ou la transcription inverse, ce qui permet d'effectuer la synthèse de l'ADNc sur les échantillons ciblés pendant qu'ils restent attachés aux billes. Les billes de capture sont fournies avec le kit SMARTer Target RNA Capture for Illumina et sont également vendues séparément.