Kit de réactifs à billes magnétiques SMARTer®

pour séquençage d'ARN en cellule uniquede protéines

SMARTer Target RNA Capture for Illumina est un système complet conçu pour générer de l'ADNc à partir d'ARN total enrichi. L'ARN-seq ciblé peut surmonter plusieurs défis inhérents aux expériences d'ARN-seq par amplification du transcriptome entier (ATA), en améliorant la couverture des séquences et la sensibilité de la détection des transcrits d'intérêt qui peuvent être présents en faibles quantités. Les approches RNA-seq ciblées présentent également l'avantage de réduire les coûts et de simplifier l'analyse. L'enrichissement des transcrits d'intérêt avant la synthèse de l'ADNc permet d'obtenir des informations sur des transcrits qui pourraient autrement passer inaperçus ou nécessiter un nombre beaucoup plus élevé de lectures de séquençage pour être détectés, notamment les fusions de gènes chimériques, les isoformes de transcrits et les variantes d'épissage. En améliorant la sensibilité, la puissance de l'analyse est également améliorée, comme le montre la réduction du rapport signal/bruit. SMARTer Target RNA Capture for Illumina est utilisé pour générer de l'ADNc à partir de transcrits d'ARN enrichis. Des sondes d'ADN biotinylées spécifiques à la cible, conçues par l'utilisateur, sont hybridées aux transcriptions d'intérêt et les hybrides ARN-ADN résultants sont capturés avec des billes de capture. Ce kit tire parti de la sensibilité du kit SMART-Seq® v4 Ultra® Low Input RNA Kit for Sequencing pour générer un ADNc complet de haute qualité à partir de ces transcrits enrichis. Le kit a été testé avec 10 ng d'ARN total, et il a été démontré qu'il pouvait effectuer la synthèse d'ADNc à partir de transcrits enrichis dérivés de seulement 100 pg d'ARN total purifié. Les bibliothèques d'ADNc générées par ce kit ont été testées pour leur compatibilité avec les plateformes de séquençage Illumina. Cette méthode ne nécessite pas de méthodes ou de kits supplémentaires d'élimination de l'ARNr.