Kit de solution tampon SMART-Seq® HT

pour séquençage ADNpour séquençage d'ARN en cellule uniquepour synthèse d'ADNc

La trousse SMART-Seq HT de base (SS-HT) et la trousse SMART-Seq HT PLUS (SS-HT PLUS) sont des trousses faciles à automatiser qui utilisent l'amorçage oligo(dT) pour générer de l'ADNc pleine longueur de haute qualité directement à partir de 1 à 100 cellules ou 10 pg-1 ng d'ARN total. En plus de la trousse de synthèse d'ADNc de base, la trousse SS-HT PLUS comprend également une trousse de préparation de librairies et des plaques à double index unique (UDI) à usage unique pour générer des librairies de séquençage compatibles avec Illumina, ce qui en fait une solution complète de bout en bout. La trousse de synthèse d'ADNc SS-HT possède un protocole simplifié optimisé pour fonctionner en aval du FACS et réduit le temps de manipulation par rapport aux trousses SMART-Seq v4, grâce à l'introduction d'une étape combinée pratique de transcription inverse et d'amplification par PCR. La technologie SMART (Switching Mechanism at 5' End of RNA Template) qui alimente la synthèse de l'ADNc permet de couvrir la totalité de la transcription, ce qui en fait un outil puissant pour l'étude de l'expression génique dans les cellules individuelles, y compris les jonctions d'épissage et l'épissage alternatif. L'amorçage Oligo(dT) est utilisé pour amplifier spécifiquement l'ARNm à partir d'un ARN total de haute qualité (RIN >8) ou de cellules intactes. La technologie LNA améliore l'efficacité du changement de matrice, ce qui augmente le nombre de gènes identifiés par rapport à d'autres méthodes. La trousse SS-HT PLUS intègre notre chimie brevetée de préparation de librairies, qui utilise la fragmentation enzymatique et des adaptateurs à boucle souche pour construire des librairies de haute qualité, compatibles avec Illumina, à partir de l'ADNc synthétisé avec la trousse de base. Ce flux de travail en deux étapes se déroule dans un seul tube et peut être réalisé en deux heures environ - aucune étape de purification intermédiaire n'est nécessaire.