Logiciel pour séquençage NGS NextGENe®

de laboratoired'analyse

Le logiciel NextGENe est le partenaire analytique idéal pour l'analyse des données de séquençage de bureau produites par les systèmes Illumina® iSeq, Miniseq, MiSeq, NextSeq, HiSeq et NovaSeq, les systèmes Ion Torrent Ion GeneStudio S5, PGM et Proton ainsi que d'autres plates-formes. Le logiciel NextGENe fonctionne sur un système d'exploitation Windows®, qui offre une interface "pointer et cliquer" conviviale pour les biologistes. Il ne nécessite pas de script ou d'autre support bioinformatique, qui sont souvent requis lors de l'utilisation de programmes tels que CLC Genomics Workbench, Lasergene's SeqMan Pro, ainsi que des logiciels académiques tels que MAQ & SOAP, Top Hat, BWA & Bowtie. Le logiciel NextGENe utilise des technologies uniques spécifiques aux plates-formes dans un ensemble autonome à applications multiples. Le logiciel NextGENe contient des modules d'analyse pour : La détection de SNP/Indel La lignée germinale Somatique Capture de l'exome, séquençage de l'exome entier (WES) Séquençage du génome entier (WGS) Analyse des variants structurels (y compris la détection des gènes de fusion) Comparaisons familiales et Trio Comparaisons tumeur-normal Détection des variations du nombre de copies (CNV) et alternative au dépistage de type MLPA assemblage de novo Transcriptome ; analyse de l'épissage alternatif et niveaux d'expression de la transcription ChIP-Seq, expression génétique numérique (DGE), analyse et quantification des ARNm et métagénomique Le logiciel NextGENe est conçu dans un environnement Windows® convivial pour les biologistes, ce qui réduit considérablement le besoin de ressources et de coûts bioinformatiques supplémentaires. Le logiciel NextGENe utilise du matériel 64 bits à faible coût basé sur le système d'exploitation Windows. (Cliquez ici pour une suggestion de configuration matérielle)