La glycosylation est un processus enzymatique au cours duquel des groupes d'hydrates de carbone sont attachés au squelette des protéines ou des lipides. La glycosylation des protéines est l'une des modifications post-traductionnelles les plus courantes et peut être observée dans tous les organismes vivants. Elle influence des processus tels que le repliement des protéines, la stabilité et l'organisation des membranes. Les kits ProMoSCOPE™ de détection de la glycosylation au niveau de la cellule unique permettent de quantifier avec précision le niveau de glycosylation de la surface cellulaire ainsi que les profils d'expression génique au niveau de la cellule unique simultanément. Ce résultat est obtenu par une méthode chimioenzymatique dans laquelle la balise ProMoSCOPE se lie de manière covalente à la N-acétylactosamine (LacNAc) à la surface de la cellule. Le niveau de glycosylation ainsi que les informations du transcriptome entier peuvent être utilisés pour une analyse approfondie de l'état et des fonctions des cellules dans des systèmes biologiques complexes.
Le kit ProMoSCOPE™ Single Cell Glycosylation Detection Kit utilise la SCOPE-chip®, une puce microfluidique portable à micropuits qui intègre plusieurs étapes du flux de travail de traitement, telles que la capture d'une cellule unique, la lyse cellulaire et la capture de l'ARNm cellulaire. Des bibliothèques prêtes pour le séquençage peuvent être préparées avec les réactifs inclus. La SCOPE-chip® est facile à utiliser et peut être utilisée manuellement sans équipement spécial. Elle convient aux cellules provenant d'une grande variété de types de tissus.
Le thymus de souris est extrait et les suspensions de cellules individuelles marquées et non marquées sont chargées sur la SCOPE-chip® et traitées par le ProMoSCOPE™ Single Cell Glycosylation Detection Kit (kit de détection de la glycosylation des cellules individuelles). Les cellules sont annotées dans le tracé UMAP et illustrées en (A). Le tracé UMAP coloré par traitement est illustré en (B).
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