Grâce à la technologie GEXSCOPE® de Singleron, les cellules sont réparties dans des micropuits individuels et les ARNm sont capturés par des billes à code-barres unique. L'ARNm est ensuite transcrit à l'envers en ADNc, suivi d'une étape de circularisation introduite par une poignée circulaire. La circularisation de l'ADNc permet de rapprocher la région V(D)J de l'amorce de séquençage. Après deux cycles d'enrichissement, les produits seront fragmentés et construits pour constituer une bibliothèque VDJ complète pour le séquençage à lecture courte d'illumina.
Efficacité élevée de capture de l'ARN et spécificité V(D)J
La recombinaison VDJ est le processus par lequel les cellules T et B assemblent au hasard différents segments de gènes - connus sous le nom de gènes variables (V), de diversité (D) et de jonction (J) - afin de générer des récepteurs uniques (connus sous le nom de récepteurs d'antigènes) qui peuvent reconnaître collectivement de nombreux types de molécules différentes. La région V(D)J est l'une des régions les plus diversifiées du génome humain, contribuant à la complexité des réponses immunitaires humaines. Par conséquent, la compréhension des séquences complètes des régions V(D)J des cellules T et B a permis de mieux comprendre les processus immunitaires.
Points forts :
- Complet - combine le profilage du transcriptome avec les séquences TCR ou BCR de pleine longueur
- Haut débit - traiter simultanément jusqu'à 10 000 cellules en une seule fois
- Taux de cartographie élevé - augmenter la proportion de cellules avec des séquences V(D)J de pleine longueur
- Efficacité de capture élevée - tirer parti de la capture polyA robuste
Applications
01
Microenvironnement immunitaire
Cellules T et B infiltrant la tumeur
02
Maladies auto-immunes
Identifier les cellules T et B anormales dans le système immunitaire
03
Transplantation
Identifier les risques de rejet lors d'une transplantation
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