Kit de réactifs en solution CLindex™

de préparation de banques d'ADNde préparation de banques d'ARN

Le kit CLindex™Sample multiplexing permet de regrouper jusqu'à 16 échantillons dans la même bibliothèque de séquençage monocellulaire. La technologie de multiplexage CLindex™ fait appel à la chimie des clics pour un marquage efficace et non biaisé des échantillons. Un groupe chimique ayant une grande affinité avec les protéines de surface des cellules et un oligo d'indexation des échantillons se liant à ce groupe chimique marquent les cellules de chaque échantillon. L'un des principaux avantages du marquage par chimie click par rapport au marquage par anticorps est que les protéines de surface cellulaire reconnues par la chimie click sont abondantes et présentes dans différentes espèces. En outre, l'ensemble du processus de marquage des échantillons ne prend que 30 minutes. Flux de travail rationalisé Les marqueurs d'échantillons sont ajoutés à l'aide de la chimie click avant le regroupement des échantillons dans un seul flux de travail GEXSCOPE®. Les cellules regroupées avec les étiquettes d'échantillon sont ensuite chargées sur une SCOPE-chip™ pour la lyse cellulaire et le code-barres. L'étiquette de l'échantillon (15nt) est flanquée d'une poignée PCR universelle et d'une queue poly(A), qui sont capturées par des billes d'oligo-dT. Les étiquettes des échantillons sont marquées d'un code-barres cellulaire. Simultanément, les ARNm de la même cellule unique sont également capturés par les billes magnétiques d'oligo-dT au niveau de leur queue poly(A) et marqués avec le même code-barres de cellule ainsi qu'avec l'UMI. Ainsi, tous les fragments d'ADNc provenant d'une même cellule ont un dénominateur commun : le code-barres de la cellule. Le code-barres cellulaire et l'étiquette CLindex garantissent que chaque transcription peut être reliée à la cellule et à l'échantillon d'origine. Efficacité élevée du marquage Quatre lignées cellulaires indépendantes (NB4, THP1, U937 et CCRF) ont été marquées à l'aide de CLindex® et regroupées en parties égales avant d'être réparties sur la puce SCOPE-chip®.