Kit de réactifs en solution FocuSCOPE™

pour la détection de mutationspour séquençage d'ARN en cellule uniquegénétique

FocuSCOPE™ est une solution de séquençage multi-omique à haut débit pour cellules uniques qui peut détecter à la fois les variants génétiques et le transcriptome à partir des mêmes cellules uniques. Ainsi, FocuSCOPE™ a fourni un outil permettant de déchiffrer le lien entre le génotype et le phénotype au niveau de la cellule unique. La technologie FocuSCOPE™ comporte deux éléments clés : des microparticules de codage cellulaire conjuguées à des oligos qui peuvent capturer efficacement l'ARNm et les séquences d'intérêt ; et une chimie réactionnelle optimisée pour l'amplification et la construction de bibliothèques de séquences d'ARNm et de séquences provenant de régions cibles. FocuSCOPE™ a été utilisé avec succès pour réaliser l'analyse monocellulaire des profils d'expression génique et des mutations ponctuelles, des gènes de fusion ou des séquences virales intracellulaires simultanément, à partir de milliers de cellules à la fois. Les données multi-omiques acquises ont permis d'obtenir un aperçu plus complet de chaque cellule individuelle. Des billes uniques conçues sur mesure Avec les billes AccuraCellTM de Singleron, de conception unique, jusqu'à 5 zones ciblées, chacune inférieure à 200 pb, peuvent être capturées simultanément. Deux bibliothèques seront construites à partir du même échantillon, une bibliothèque pour la transcriptomique complète avec les sondes poly (dT), une bibliothèque pour les séquences ciblées avec les sondes personnalisées. Par conséquent, les informations relatives au type de cellule ainsi que les séquences ciblées (mutation, gène de fusion ou séquence virale) peuvent être détectées dans la même cellule. Détection spécifique des mutations pilotes Les kits FocuSCOPE® détectent les mutations pilotes dans des tissus hétérogènes avec une grande spécificité. Dans un ensemble de données de démonstration ci-dessous provenant d'un mélange de trois lignées cellulaires, la lignée cellulaire H1975 porte la mutation ponctuelle EGFR T790M, et la lignée cellulaire A549 porte la mutation KRAS G12S.