Le séquençage de l'ARN unicellulaire nécessite généralement une suspension unicellulaire préparée à partir d'échantillons frais. Pour le séquençage d'une seule cellule à partir de tissus congelés, nous proposons un produit spécialisé, le GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit. Le kit GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit est une solution complète pour transformer les tissus en noyaux uniques et convertir l'ARNm contenu dans les noyaux uniques en bibliothèques NGS.
Le GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library Kit peut non seulement être utilisé pour analyser des échantillons de tissus congelés, mais il peut également être appliqué au séquençage de noyaux uniques de cellules congelées isolées par tri FACS. En outre, le kit GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library peut également être utilisé pour l'analyse de cellules uniques de grand diamètre ou de forme irrégulière, telles que les neurones.
Exemple d'un ensemble de données expérimentales
Des tissus congelés d'hippocampes de souris ont été traités à l'aide du kit GEXSCOPE® Single Nucleus RNA Library. Après l'isolement, le partitionnement et le codage à barres des noyaux, une bibliothèque de noyaux uniques a été séquencée et les données obtenues ont été regroupées. Sur la base des profils d'expression des gènes marqueurs, les principaux sous-types cellulaires (neurones excitateurs, neurones inhibiteurs, cellules gliales, neuroblastes et oligodendrocytes) ont été annotés à l'aide de la base de données SynEcoSys.
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