La préparation des échantillons pour le séquençage de nouvelle génération (NGS) comporte une multitude d'étapes et chacune d'entre elles est essentielle à la réussite et à l'efficacité du séquençage, et toutes les étapes doivent être optimisées en termes de réactifs et de protocole. Compte tenu de la nature précieuse des échantillons NGS, un flux de travail intégré avec des réactifs optimisés est nécessaire pour convertir les échantillons en une bibliothèque prête pour le séquençage. Les types d'échantillons NGS peuvent différer en termes de :
Facilité de séquençage - uniforme ou avec des structures secondaires ou des zones riches en GC
Qualité - fraîchement extraits ou conservés (fixés au formol et inclus dans la paraffine - FFPE)
Flux de travail flexibles - flux de travail pour l'ADN et l'ARN optimisés pour les applications
Compte tenu de toutes ces variations, il est important d'utiliser des réactifs de préparation de librairies capables de travailler efficacement avec tous ces types d'échantillons. Des réactifs de préparation de librairies de haute qualité permettent d'obtenir une couverture uniforme et améliorée ainsi que des taux de duplication plus faibles. En fonction de l'objectif final (par exemple, le séquençage de l'exome entier), une étape d'enrichissement de la cible peut également être nécessaire pour enrichir des régions spécifiques d'intérêt. L'utilisation de réactifs d'enrichissement de cible à haute efficacité permet d'obtenir une couverture uniforme et de grande profondeur avec une spécificité élevée (taux de ciblage) sur les régions ciblées.
Le flux de travail KAPA HyperPETE combine des produits validés pour la préparation de librairies KAPA et l'enrichissement de cibles KAPA. Il fournit tous les accessoires et réactifs nécessaires à la préparation des échantillons, de l'ADN ou de l'ARN au séquenceur, dans un flux de travail d'une seule journée. Les nouveaux panels KAPA HyperPETE offrent une grande efficacité de capture, une uniformité de séquençage avec moins d'optimisation et une plus grande confiance dans la détection des variants.
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