Pipelines d'analyse RNA-seq prêts à l'emploi utilisant les algorithmes CLC de QIAGEN
Compatible avec les kits de préparation de librairies les plus couramment utilisés
Exploration et filtrage faciles et intuitifs des gènes différentiellement exprimés dans un tableau de bord interactif convivial
Aide à l'interprétation grâce à l'annotation des voies les plus impactées, en amont
régulateurs en amont, les maladies et les fonctions les plus impactées, à partir de la base de connaissances QIAGEN Ingenuity Pathway Analysis (IPA)
Aide à la décision pour les expériences de vérification des biomarqueurs avec le produit
recommandations de produits et des outils pratiques de conception personnalisée dans le QIAGEN GeneGlobe Design & Analysis Hub
Détails du produit
Les solutions GeneGlobe Analyze combinent des algorithmes et des connaissances à la pointe de l'industrie avec une grande facilité d'utilisation. Le portail d'analyse RNA-seq QIAGEN basé sur le cloud est accessible à partir de GeneGlobe Analyze et permet l'analyse des données RNA-seq, de l'alignement des lectures brutes à l'interprétation des gènes différentiellement exprimés et à la recherche des bons outils pour la vérification des biomarqueurs potentiels.
Performance de l'analyse
Le portail d'analyse RNA-seq de QIAGEN réduit le temps d'analyse de plusieurs jours à quelques heures seulement :
analyse des microARN : 90 minutes suffisent pour passer du fichier fastq à l'expression différentielle (d'après les données du kit QIAseq miRNA Library, 96 échantillons avec ~5 millions de lectures par échantillon, lectures de 75 pb à extrémité unique)
Analyse du transcriptome entier : 4 heures suffisent pour passer du fichier fastq à l'expression différentielle (sur la base des données du kit QIAseq Stranded RNA Library, 96 échantillons, 60 millions de lectures par échantillon, paired-end 2 x 75 bp reads)
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