Toutes les bactéries et les archées contiennent une sous-unité ribosomique appelée 16S, longue d'environ 1 500 nucléotides et contenant neuf régions hypervariables (V1-V9) réparties entre des régions hautement conservées qui sont spécifiques au genre ou à l'espèce. Le séquençage du gène de l'ARN ribosomique (ARNr) 16S, marqueur génétique reconnu, est l'étalon-or de l'analyse des échantillons bactériens pour l'identification et la classification des cultures pures et l'analyse des échantillons mixtes. Grâce à l'introduction du séquençage de nouvelle génération (NGS), la méthode de l'ARNr 16S est désormais largement utilisée pour déconvoluer des communautés microbiennes complexes, telles que les microbiomes de l'intestin humain.
La région V1-V9 est mieux à même de distinguer les espèces bactériennes que les autres sous-régions. EasySeq™ 16S rRNA V1-V6 et V9 Bacterial ID fournit l'analyse complète des régions variables V1-6 et V9 du gène 16S rRNA bactérien. Ce kit soutient une stratégie d'identification bactérienne pilotée par NGS pour les maladies infectieuses, les enquêtes de contamination et les tests d'analyse des causes profondes à partir d'échantillons cliniques.
Compatibilité du kit et de la plateforme
Remarque : le kit EasySeq™ 16S rRNA V1-6 et V9 Bacterial ID NGS Library Prep est conçu pour séquencer les régions hypervariables V1-V6 et V9 dans une réaction multiplex à l'aide de deux panels de sondes différents. Ce kit nécessite deux plaques uniques à double index pour une utilisation associée.
Le kit de séquençage EasySeq™ 16S rRNA V1-6 et V9 Bacterial ID est utilisé avec de l'ADN extrait de cultures pures et permet également l'amplification directe d'ADN à partir de matériel clinique.
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