NEX-t Panel v1.0 cible une série de séquences caractéristiques sélectionnées dans les génomes de centaines d'agents pathogènes, notamment des virus, des bactéries, des champignons et des parasites. Il couvre un large éventail de contenus, notamment les 16S/ITS, les gènes domestiques, les gènes liés à la résistance aux médicaments, etc.
Performance
Conception innovante et unique
Le panneau NEX-t v1.0 se compose principalement des trois éléments suivants :
(1) des sondes conçues pour des séquences caractéristiques de centaines d'espèces, y compris des virus, des bactéries, des champignons et des parasites, comme indiqué dans le tableau 1.
● Comparaison de plusieurs séquences de référence au sein d'espèces ou de genres, sélectionnant des régions dans la plage de tolérance des sondes et contenant un certain degré de diversité.
● Incorporation de séquences impliquées dans le typage de séquences multi-locus (MLST).
● Intégration de la littérature pertinente.
(2) Un petit ensemble de sondes universelles conçues pour 16S/ITS.
● Référence à partir de plusieurs bases de données (SILVA,Greengenes,RDP,Unite)
(3) Sondes conçues pour la résistance aux médicaments, la virulence et les gènes connexes.
---