Kit de réactifs en solution Ext-RNA

pour la recherchede gènes

Les mélanges de contrôle ERCC RNA Spike-in sont développés par le National Institute of Standards and Technology (NIST) et sont composés d'une série de séquences d'ARN avec des concentrations déterminées. Il permet d'obtenir des courbes standard reliant le nombre de lectures à la concentration d'ARN et est largement utilisé dans l'évaluation des performances des expériences d'expression génique. Ext-RNA Control Panel v1.0 a ciblé 24 des 92 transcrits ERCC d'une longueur de 273 à 2 022 pb, avec une concentration allant de 0,014305 attomol/μL à 937,5 attomol/μL. Les 24 ARN ERCC serviront de contrôles externes pour la quantification de l'expression des ARN. Les échantillons d'ARN peuvent-ils être directement utilisés pour la préparation de librairies avec ce kit ? Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie. Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ? Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification. Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ? Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité. Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ? Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng. Augmentez le volume de données pour améliorer la sensibilité des clones à faible fréquence. Ce kit est-il adapté à la surveillance de la maladie résiduelle minimale (MRD) ? Oui. Ce kit comprend le mélange d'amorces IG et le mélange d'amorces TR avec des amorces spécifiques aux gènes fournies dans des tubes séparés,