NanOnCT Panel v1.0 est un panel compact conçu pour l'analyse des tumeurs solides et des biopsies liquides. Ce panel comprend un nombre total de 69 gènes avec des régions sélectionnées couvertes. Grâce à la conception optimisée des sondes, ce panel offre une couverture très uniforme des régions ciblées, tant pour l'ADN FFPE que pour l'ADN acellulaire.
Les échantillons d'ARN peuvent-ils être utilisés directement pour la préparation de librairies avec ce kit ?
Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie.
Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ?
Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification.
Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ?
Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité.
Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ?
Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng. Augmentez le volume de données pour améliorer la sensibilité des clones à faible fréquence.
Ce kit est-il adapté à la surveillance de la maladie résiduelle minimale (MRD) ?
Oui. Ce kit comprend un mélange d'amorces IG et un mélange d'amorces TR avec des amorces spécifiques aux gènes fournies dans des tubes séparés, ce qui permet une combinaison flexible dans une seule réaction d'amplification. Grâce à sa grande sensibilité, le kit répond aux exigences du développement de la technologie de surveillance de la MRD et des applications cliniques, ce qui le rend idéal pour les scénarios de détection de variants à faible fréquence.
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