HiSNP Ultra Panel v1.0 est conçu pour analyser l'état de la composition génomique avec une haute résolution. Ce panel basé sur un squelette de SNP peut analyser l'ensemble du génome à 50 Kb d'intervalle en ciblant plus de 52 000 sites SNP à MAF élevé.
HiSNP Panel v1.0 est conçu pour analyser l'état de la composition génomique avec une résolution de base. Ce panel basé sur un squelette de SNP peut balayer l'ensemble du génome à une distance de 300 Kb en ciblant plus de 9 000 sites SNP à MAF élevé.
Caractéristiques
Rapport d'hétérozygotie élevé : Conception complète pour les Européens, les Africains, les Américains et les Asiatiques (AF=0,05-0,95)
Performance de capture stable : GC équilibré ; séquence flanquante unique (vérifiée par WGS)
Proportionnalité appropriée : Distribution homogène dans l'ensemble du génome ; sites LD exclus
Compatibilité supérieure : Utilisation seule ou en association avec d'autres panels CDS
Les échantillons d'ARN peuvent-ils être utilisés directement pour la préparation de librairies avec ce kit ?
Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie.
Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ?
Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification.
Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ?
Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité.
Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ?
Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng.
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