Kit de réactifs en solution OncoFu Elite v1.0

pour la recherchepour analyse d'ARN

Le panel OncoFu Elite (pour l'ARN) v1.0 cible 105 gènes qui sont les plus courants ou les plus pertinents pour les fusions cliniquement significatives dans les études sur les tumeurs solides. Les sondes couvrent toutes les régions codantes des transcrits et certaines régions UTR impliquées dans l'apparition de fusions qui sont officiellement incluses dans RefSeq 109. Le panel permet d'enrichir les informations sur les fusions, les mutations et l'expression des gènes au niveau de l'ARN. Les échantillons d'ARN peuvent-ils être utilisés directement pour la préparation de librairies avec ce kit ? Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie. Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ? Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification. Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ? Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité. Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ? Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng. Augmentez le volume de données pour améliorer la sensibilité des clones à faible fréquence. Ce kit est-il adapté à la surveillance de la maladie résiduelle minimale (MRD) ? Oui. Ce kit comprend un mélange d'amorces IG et un mélange d'amorces TR avec des amorces spécifiques aux gènes fournies dans des tubes séparés, permettant une combinaison flexible dans une seule réaction d'amplification.