Kit de réactifs en solution NanOnco Plus Panel v3.0

pour la recherchede diagnosticpour le gène HLA-B

Le panel NanOnco Plus v3.0 cible les régions codantes complètes de 620 gènes (y compris les gènes HLA) présentant un intérêt pour les études sur les tumeurs solides, une série de régions intron liées à des fusions courantes, des séquences microsatellites classiques et des loci polymorphes associés à la chimiothérapie. Ce panel comprend un nombre total de 637 gènes, couvrant une région cible d'environ 2,4 Mb du génome. Il permet l'enrichissement de multiples variantes, notamment la substitution de bases, l'insertion/délétion, le réarrangement de gènes, l'amplification de gènes, l'instabilité des microsatellites, etc. Les échantillons d'ARN peuvent-ils être utilisés directement pour la préparation de librairies avec ce kit ? Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie. Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ? Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification. Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ? Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité. Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ? Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng. Augmentez le volume de données pour améliorer la sensibilité des clones à faible fréquence.