Kit de réactifs en solution NEX-t Panel v1.0

pour la recherchepour bactériesde Fungi

NEX-t Panel v1.0 cible une série de séquences caractéristiques sélectionnées dans les génomes de centaines d'agents pathogènes, notamment des virus, des bactéries, des champignons et des parasites. Il couvre un large éventail de contenus, notamment les 16S/ITS, les gènes domestiques, les gènes liés à la résistance aux médicaments, etc. Performance Conception innovante et unique Le panneau NEX-t v1.0 se compose principalement des trois éléments suivants : (1) des sondes conçues pour des séquences caractéristiques de centaines d'espèces, y compris des virus, des bactéries, des champignons et des parasites, comme indiqué dans le tableau 1. ● Comparaison de plusieurs séquences de référence au sein d'espèces ou de genres, sélectionnant des régions dans la plage de tolérance des sondes et contenant un certain degré de diversité. ● Incorporation de séquences impliquées dans le typage de séquences multi-locus (MLST). ● Intégration de la littérature pertinente. (2) Un petit ensemble de sondes universelles conçues pour 16S/ITS. ● Référence à partir de plusieurs bases de données (SILVA，Greengenes，RDP，Unite) (3) Sondes conçues pour la résistance aux médicaments, la virulence et les gènes connexes. Les échantillons d'ARN peuvent-ils être directement utilisés pour la préparation de bibliothèques avec ce kit ? Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie. Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ? Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification. Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ? Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité.