Réactif en solution NEXome

Sur la base de la dernière version de Refseq (109, 2021) et de la base de données CCDS, le NEXome Core Panel a soigneusement sélectionné certaines régions qui méritent d'être prises en compte en dehors de la base de données. Parallèlement, pour des raisons de continuité du produit, certaines régions supprimées dans la dernière version de la base de données ont été conservées. Le NEXome Core Panel contient environ 400 000 sondes d'ADN simple brin, synthétisées et contrôlées indépendamment pour leur qualité, ciblant une région génomique de 34,7 Mb (19 613 gènes). Le NEXome Core Panel est un panel de base pour tous les exomes, qui peut être combiné avec différents panels de spike-in pour répondre à différentes exigences d'application. Production et contrôle de la qualité Synthèse et contrôle de qualité indépendants Les échantillons d'ARN peuvent-ils être directement utilisés pour la préparation de librairies avec ce kit ? Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie. Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ? Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification. Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ? Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est d'environ 270 pb. Le séquençage PE150 est recommandé pour une couverture de haute qualité. Quel est le volume de données de séquençage recommandé pour l'analyse du répertoire immunitaire IGTR ? Un minimum de 0,3 Gb est recommandé pour détecter des clones à une abondance de 0,01 % avec une entrée de 200 ng. Augmentez le volume de données pour améliorer la sensibilité des clones à faible fréquence.