NEXome Plus Panel v1.0 est un panel amélioré de capture de l'exome entier. Il étend les régions cibles au squelette SNP du génome entier, aux régions introniques liées à la fusion commune de gènes dans les tumeurs solides et aux loci microsatellites classiques sur la base du panel NEXome Core, qui couvre une région de 43,3 Mb du génome humain.
Squelette SNP du génome entier
Sur la base de la base de données 1000 génomes, nous sélectionnons principalement >9 000 loci présentant des valeurs MAF élevées et une forte hétérozygotie dans la population chinoise, couvrant l'ensemble du génome humain à des intervalles d'environ 300 Kb. Elle fournit des informations plus riches et plus uniformément réparties sur la composition génomique à partir de l'exome entier et peut être utilisée pour la détection des CNV et de la perte d'hétérozygotie.
Loci microsatellites classiques
Le NEXome Core Panel lui-même couvre un grand nombre de loci microsatellites, et l'ajout de 15 loci classiques MSI conçus de manière optimale facilite la comparaison entre différentes méthodes d'analyse de l'instabilité des microsatellites ainsi que l'optimisation et l'étalonnage du processus analytique.
Les échantillons d'ARN peuvent-ils être utilisés directement pour la préparation de librairies avec ce kit ?
Non. Ce kit n'est compatible qu'avec de l'ADNg ou de l'ADNc comme échantillons initiaux. Pour les échantillons d'ARN, une transcription inverse pour générer de l'ADNc est nécessaire avant la préparation de la librairie.
Quelle est la plage d'entrée recommandée ? Comment traiter les entrées dépassant cette plage ?
Ce kit prend en charge 50 à 2 000 ng d'ADNg ou d'ADNc. Si la quantité d'entrée dépasse 2 000 ng, diviser l'échantillon en plusieurs réactions pour maintenir l'efficacité de l'amplification.
Quelle est la taille d'insertion de ce kit ? Comment sélectionner la longueur de la lecture de séquençage ?
Le pic principal des produits PCR obtenus à l'aide de ce kit est de ~270 pb.
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