Le labyrinthe en Y est semblable au labyrinthe en T, sauf qu'il comporte trois bras à 120 degrés l'un de l'autre. Le rongeur ou la souris commence à l'extrémité d'un bras, puis choisit entre les deux autres. L'alternance spontanée est mesurée pour démontrer l'apprentissage.
Le maillage en Y est souvent préféré au maillage en T parce que les virages graduels diminuent le temps d'apprentissage par rapport aux virages serrés du maillage en T. Il s'agit également d'un labyrinthe* plus petit qui réduit la liberté de mouvement de l'animal en le concentrant sur la tâche à accomplir. Le labyrinthe en Y peut également être appâté avec de la nourriture pour une alternance récompensée. Les puits alimentaires ont une profondeur standard de 1 cm.
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