Kit de réactifs en solution QuantSeq

pour préparation d'échantillonsNGSpour acides nucléiques

Analyse rentable de l'expression des gènes à l'échelle du génome Économie de la profondeur de séquençage en ne générant qu'un seul fragment par transcription Protocole tout-en-un simple et rapide : moins de 4,5 heures Convient aux échantillons à faible entrée (1 ng d'ARN total) et aux échantillons FFPE Pipeline d'analyse des données gratuit pour les non-bio-informaticiens UMIs pour la détection des duplicatas PCR disponibles NOUVEAU ! Bundles avec jusqu'à 384 Unique Dual Indices (UDIs) La trousse QuantSeq FWD est un protocole de préparation de bibliothèques conçu pour générer des bibliothèques compatibles avec Illumina de séquences proches de l'extrémité 3' de l'ARN polyadénylé. QuantSeq FWD contient la séquence de liaison Read 1 d'Illumina dans l'amorce de synthèse du deuxième brin, de sorte que les lectures NGS sont générées vers la queue poly(A), reflétant directement la séquence de l'ARNm (voir le flux de travail). Cette version est la norme recommandée pour l'analyse de l'expression génétique. Lexogen propose en outre une version à haut débit avec double indexation optionnelle (indices i5 et i7) permettant de multiplexer jusqu'à 9 216 échantillons sur une seule voie. Cartographie des sites de fin de transcription En utilisant des lectures plus longues, QuantSeq FWD permet de localiser exactement l'extrémité 3' de l'ARN poly(A) (voir la figure 3) et donc d'obtenir des informations précises sur l'UTR 3'. Analyse d'échantillons de faible quantité et de faible qualité La quantité recommandée d'ARN total en entrée est aussi faible que 1 ng. QuantSeq permet de générer de manière reproductible des librairies à partir d'ARN de faible qualité, y compris des échantillons FFPE. Voir les figures 1 et 2 pour une comparaison de deux qualités différentes d'ARN (FFPE et cryoblocs frais congelés) du même échantillon.