aRNm-Seq incluant la sélection poly(A)
Large gamme d'entrée d'ARN total (1 ng à 1 μg)
Flux de travail facile tout-en-un
De la sélection poly(A) aux bibliothèques prêtes à être séquencées en 5,5 heures
Identificateurs moléculaires uniques (UMI) inclus
indices doubles uniques (UDI) de 12 nt inclus
La trousse de préparation de librairies mRNA-Seq de CORALL permet de générer rapidement et de manière rentable des librairies de brins, marquées par des UMI et à double indexation unique pour les analyses du transcriptome entier de l'ARN poly(A) à l'aide des plateformes NGS d'Illumina®.
Couverture supérieure de bout en bout
La couverture complète de CORALL permet une meilleure représentation des sites de début et de fin de transcription. La couverture des lectures a été analysée à l'aide des contrôles de pointes ERCC, qui présentent des sites de début et de fin de transcription précis et connus (TSS et TES, respectivement). Les lectures de CORALL correspondent plus précisément au SCT exact de l'ERCC (Fig. 3A) que les bibliothèques concurrentes, qui ne couvrent pas les véritables sites de début. De plus, CORALL fournit une couverture élevée au niveau du TES (Fig. 3B).
Analyse des données
Un pipeline d'analyse de données est maintenant disponible sur la plateforme BlueBee® Genomics. Le pipeline fourni permet aux utilisateurs du kit d'effectuer le contrôle de qualité des lectures, la cartographie, la déduplication de l'identifiant moléculaire unique (UMI) et la quantification des transcriptions. Pour utiliser votre code d'activation, enregistrez un compte avec BlueBee (https://lexogen.bluebee.com/portal) et téléchargez vos données (fichiers fastq.gz).
NOTE ! L'analyse de données BlueBee est disponible pour une série d'espèces, veuillez vous référer à la FAQ 7. Des génomes de référence pour de nouvelles espèces peuvent être ajoutés sur demande. Veuillez noter que cela entraîne des frais. Voir CORALL Data Analysis, pour plus de détails.
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