Kit flexible pour le séquençage ciblé et le code-barres moléculaire
Identification de transcrits de fusion connus et inconnus
Utilisation d'amorces spécifiques du gène conçues sur mesure pour la synthèse du premier et/ou du second brin
et/ou la synthèse du second brin
Alternative rentable et flexible aux panels de séquençage préconçus
Séquençage d'un maximum de 9 126 échantillons par voie
La trousse QuantSeq-Flex est un protocole de préparation de librairies conçu pour créer des librairies compatibles avec Illumina à partir de n'importe quel échantillon d'ARN à l'aide d'amorces personnalisées. Il est ouvert au développement par les utilisateurs avancés de RNA-Seq en fonction de leurs besoins personnalisés.
La trousse est basée sur la stratégie de la trousse QuantSeq FWD pour Illumina (no de cat. 015), avec des réactifs compatibles et une séquence de liaison Read 1 introduite par l'amorce de synthèse du deuxième brin. Par conséquent, les lectures générées pendant le cycle NGS correspondent directement à la séquence de l'ARN.
Le kit QuantSeq-Flex fournit des modules pour la transcription inverse (RT) et la synthèse du second brin, ce qui permet aux utilisateurs de choisir leurs propres amorces pour l'une ou l'autre de ces étapes ou pour les deux. Cela offre une flexibilité maximale dans le choix des cibles et du matériel d'entrée.
Ce kit QuantSeq très flexible permet de générer les types de bibliothèques suivants :
1.) Amorcée par OligodT dans la transcription inverse, amorcée de manière aléatoire dans la synthèse du second brin (QuantSeq 3' mRNA-Seq)
2.) OligodT amorcé par transcription inverse, amorcé de manière spécifique à la cible dans la synthèse du second brin (targeted 3' mRNA-Seq)
3.) Amorçage spécifique à la cible dans la transcription inverse, amorçage aléatoire dans la synthèse du second brin (ARN-Seq ciblé, permet l'identification de nouvelles fusions)
4.) Amorçage spécifique de la cible lors de la transcription inverse, amorçage spécifique de la cible lors de la synthèse du second brin (ARN-Seq ciblé, détection des cibles connues uniquement)
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