Kit de réactifs en solution QuantSeq-Pool

de préparation de banques d'ARN

Méthode rentable d'analyse de l'expression génétique pour les projets de criblage La mise en commun précoce et le traitement par lots permettent de gagner du temps sans effort Facilement modulable, de quelques échantillons à 36 864 QuantSeq-Pool est la solution optimale pour le profilage de l'expression génique dans le cadre de projets de criblage de grande envergure, grâce à l'utilisation de codes-barres pour les échantillons, à la mise en commun précoce et au traitement par lots de 96 échantillons au maximum dans une réaction, ce qui permet d'obtenir un flux de travail facilement évolutif pour le multiplexage de 36 864 échantillons. Haute spécificité de brin QuantSeq-Pool maintient une spécificité de brin exceptionnelle de >99,9 % et permet de mapper les lectures à leur brin correspondant sur le génome, ce qui permet la découverte et la quantification de transcrits antisens et de gènes qui se chevauchent. Comptage direct pour la quantification de l'expression génétique Un seul fragment par transcrit est produit ; par conséquent, aucune normalisation de la longueur n'est nécessaire. Cela permet de déterminer plus précisément les valeurs d'expression des gènes et fait de QuantSeq la meilleure alternative aux microréseaux et à l'ARN-Seq conventionnel dans les études d'expression des gènes. Analyse bioinformatique simple La cartographie des lectures est simplifiée en sautant la détection des jonctions. Les lectures sont générées à l'extrémité 3′ des transcrits, où il n'y a pratiquement pas de jonctions. Le traitement des données peut donc être accéléré en utilisant, par exemple, Bowtie2 au lieu de TopHat2. Identificateurs moléculaires uniques Les UMI sont intégrés à QuantSeq-Pool et sont introduits à la toute première étape du protocole. Les UMI ont une longueur de 10 nucléotides et sont lus au début de la lecture 2. Utilisez les informations de l'UMI pour identifier les doublons de PCR et éliminer les biais d'amplification.