Analyser la cinétique de la synthèse et du renouvellement de l'ARN à l'échelle du transcriptome
Mesurer l'expression de l'ARN naissant et la stabilité des transcriptions
Améliorer la résolution temporelle de l'expression différentielle
Identifier les cibles transcriptionnelles primaires et secondaires
Aucun pull-down ou isolement biochimique n'est nécessaire
Utilisez cette technique en combinaison avec QuantSeq 3' mRNA-Seq pour un séquençage métabolique à haut rendement,
pour un séquençage métabolique rentable et à haut débit
SLAMdunk - pipeline automatisé et convivial d'analyse des données SLAMseq-QuantSeq
sur la plateforme d'analyse génomique BlueBee ®
SLAMseq est une méthode de haute sensibilité pour la mesure résolue dans le temps de l'ARN nouvellement synthétisé et existant dans les cellules en culture. SLAMseq permet la résolution des cinétiques de synthèse et de dégradation de l'ARN.
Lexogen propose une famille de kits basés sur la nouvelle méthode SLAMseq : Thiol (SH)-Linked Alkylation for the Metabolic sequencing of RNA. SLAMseq permet l'identification et la quantification de l'ARN nouvellement synthétisé (naissant) et de l'ARN existant à partir du même échantillon en parallèle, sans nécessiter d'isolement biochimique. SLAMseq peut être facilement appliqué aux expériences sur cellules vivantes. Associée à la préparation de librairies QuantSeq 3' mRNA-Seq, SLAMseq constitue une solution complète, conviviale et à haut débit pour l'analyse de la synthèse et de la cinétique de renouvellement de l'ARN à l'échelle du transcriptome.
La gamme de kits SLAMseq comprend les modules Explorer et Kinetics, qui couvrent l'ensemble de l'expérience de marquage de l'ARN métabolique, de l'optimisation des conditions de marquage au marquage de l'ARN naissant ou existant et à l'alkylation pour la préparation de la bibliothèque NGS en aval.
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