Le panel de déplétion de l'ARN DepleteX élimine les transcrits insuliniques les plus expressifs in-vitro avant le séquençage, redistribuant les clusters de séquençage vers des transcrits uniques biologiquement pertinents - ce qui vous permet de maximiser l'UMI et la sensibilité des gènes.
Au-delà de la ribodéplétion, les échantillons d'ARN comportent généralement un petit nombre de transcrits hautement exprimés et bien caractérisés, et le reséquençage de ces transcrits n'apporte que peu d'informations pertinentes d'un point de vue biologique. Malheureusement, ces transcrits hautement exprimés rivalisent avec les transcrits faiblement exprimés pour la couverture de séquençage. Ce manque de couverture de séquençage, associé à un bruit important provenant des transcrits à forte expression, limite la détection des gènes à faible expression, des variants rares et des événements de fusion uniques qui peuvent être des facteurs de maladie.
Points forts
Panel d'insuline conçu pour épuiser les transcrits surexprimant dans les échantillons de pancréas
Réaffectation des lectures de séquençage aux transcrits à faible expression pour une meilleure couverture
Maximiser la détection des variantes et des isoformes avec moins de séquençage
À propos de
Le kit contient de l'ARN guide spécifique au tissu et des réactifs de déplétion pour la déplétion post-bibliothèque
Spécification
Échantillons par kit - 24
Tissus évalués dans le modèle - Pancréas
Conçu pour épuiser - 2 gènes de l'insuline
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