Le kit de déplétion de la globine DepleteX élimine in vitro quatre transcrits de globine hautement exprimés avant le séquençage, redistribuant les grappes de séquençage vers des transcrits uniques biologiquement pertinents, ce qui vous permet de maximiser l'UMI et la sensibilité des gènes.
Au-delà de la ribodéplétion, les échantillons d'ARN comportent généralement un petit nombre de transcrits hautement exprimés et bien caractérisés, et le reséquençage de ces transcrits n'apporte que peu d'informations biologiquement pertinentes. Malheureusement, ces transcrits hautement exprimés rivalisent avec les transcrits faiblement exprimés pour la couverture de séquençage. Ce manque de couverture de séquençage, associé à un bruit important provenant des transcrits à forte expression, limite la détection des gènes à faible expression, des variants rares et des événements de fusion uniques qui peuvent être des facteurs de maladie.
Points forts
Déplétion simple et non biaisée de la globine humaine dans les bibliothèques RNA-Seq
Déplétion à plus de 99 % de la globine contaminante
Incubation rapide d'une heure pour la déplétion
Environ
Kit conçu pour dépléter quatre gènes de globine humaine (HBA1, HBA2, HBB, HBD)
Spécification
Échantillons par kit - 24
Tissus évalués dans le modèle - Sang
Conçu pour appauvrir - HBA1, HBA2, HBB et HBD
Compatibilité avec les produits CRISPRclean - Cellule unique et ribodéplétion
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