Notre kit DepleteX High Expressing RNA Depletion élimine les transcrits les plus expressifs in-vitro avant le séquençage, redistribuant ~70%* des lectures de séquençage vers des transcrits uniques biologiquement pertinents, ce qui vous permet de maximiser la détection des transcrits faiblement expressifs ou des isoformes rares.
Augmentation de la sensibilité de détection dans les fibroblastes et le sang total
Le reséquençage de transcrits à forte expression n'apporte que peu d'informations biologiquement pertinentes. Malheureusement, ces transcrits rivalisent avec les transcrits faiblement exprimés pour la couverture de séquençage. Ce manque de couverture, associé au bruit important des transcrits à forte expression, limite la détection des gènes à faible expression, des variants rares et des événements de fusion uniques qui peuvent être des facteurs de maladie.
DepleteX utilise Cas9 et un ensemble d'ARN guides conçus pour éliminer 70 % des transcrits les plus expressifs des librairies RNA-Seq sélectionnées par poly-A et dérivées de fibroblastes et de sang total. Cet ensemble de guides a été conçu pour maximiser la réaffectation des lectures de séquençage totales afin d'augmenter la couverture de séquençage des transcrits rares à faible expression et des événements de fusion uniques.
Points forts
Suppression de >4 000 transcrits hautement exprimés dans le sang total et les fibroblastes
Attribution de ~70 %* de lectures supplémentaires à des transcrits biologiquement pertinents faiblement exprimés
Maximiser la détection des variantes et des isoformes avec moins de séquençage
Détection accrue des transcrits à faible expression
Intégration facile dans votre flux de travail grâce à un protocole simple et flexible
À propos de
Le kit comprend de l'ARN guide et des réactifs de déplétion pour la déplétion post-bibliothèque.
Spécification
Échantillons par kit - 24
Tissus évalués dans le modèle - Fibroblaste, sang total
Contenu de la déplétion - ~4 450 transcrits à haut niveau d'expression
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