Module logiciel pour séquençage HLA SEQHLA

de laboratoired'analyse

SEQHLA est une application puissante et conviviale pour l'analyse des données de typage basées sur les séquences HLA provenant de toutes les plates-formes de séquençage Sanger. Toutes les versions de la base de données HLA IMGT peuvent être téléchargées et importées. Il utilise un appel de base d'apprentissage unique basé sur les données statistiques de la zone de pic et possède sa propre fonction d'édition automatique. Les positions constantes peuvent être ignorées pour l'analyse si on le souhaite. Le résultat peut être affiché en résolution maximale, 1 champ ou 2 champs et en code NMPD. Toutes les données de résultats peuvent être transférées vers les systèmes LIM internes des laboratoires et / ou émises sous forme de rapports personnalisés pour les patients. Compatible avec les données de toutes les plateformes et kits de séquençage Sanger courants Configuration facile de régions cibles individuelles basées sur la base de données HLA de l'IMGT Appel de base configurable avec des seuils dépendant du séquenceur Découpage automatique et défini par l'utilisateur des fichiers de résultats de séquençage Tous les résultats d'un patient sont affichés sur un seul écran, y compris les combinaisons d'allèles détectées Avertissement automatique en cas de mutations du site d'épissage Possibilité d'ignorer les positions constantes pour l'analyse Détection de nouveaux allèles Affichage des résultats dans différentes résolutions (1 champ, 2 champs et résolution maximale) et sous forme de code NMDP Statistique de la zone de pic : comparaison automatique avec tous les échantillons précédemment analysés pour une détection sensible des positions hétérozygotes, même en cas d'abandon d'un allèle Rapport HLA détaillé pour chaque patient / commande