Développés en collaboration avec des experts en génomique du cancer, ces oligos préconçus et prêts à l'emploi permettent aux chercheurs de séquencer une variété de gènes et de polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) précédemment liés à la prédisposition au cancer.
Cible 94 gènes et 284 SNP associés à une prédisposition au cancer
TruSight Cancer comprend des gènes associés à des cancers courants (p. ex. cancer du sein, cancer colorectal) et à des cancers rares. En outre, l'ensemble comprend 284 SNP dont la corrélation avec le cancer a été établie par des études d'association à l'échelle du génome (GWAS). La sélection du contenu s'est faite sur la base d'une curation experte de la littérature scientifique et d'autres ressources de haute qualité.
Le panel de séquençage TruSight Cancer fournit des oligos personnalisés ciblant les régions d'intérêt identifiées. Une quantité suffisante de produit est fournie pour quatre réactions d'enrichissement. TruSight Cancer est compatible avec TruSight Rapid Capture.
Échantillons de données TruSight Cancer
6 échantillons de référence humains ont été préparés à l'aide du panel de séquençage TruSight Cancer. Ces librairies ont été séquencées sur le système MiniSeq à l'aide d'un kit à haut rendement avec une configuration de longueur de lecture de 2 x 100 pb avec double indexation. Le rendement total était de 5,2 Gb avec 95,8 % de bases au niveau ou au-dessus de Q30.
Spécifications
Durée de l'essai - 1,5 jour
Type de cancer - Pan-cancer
Spécifications du contenu - Ensemble fixe de sondes qui enrichissent 94 gènes et 284 SNP associés à des cancers communs et rares.
Description - Recherche de détection des mutations germinales pour les cancers courants et rares.
Temps d'utilisation - 5 heures
Quantité d'entrée - 50 ng d'ADN
Instruments - Système MiSeq, système NextSeq 550, MiSeqDx en mode recherche, système MiniSeq, système NextSeq 500
Méthode - séquençage ciblé de l'ADN, enrichissement de la cible
Multiplexage - Jusqu'à 96 paires
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