L'AmpliSeq for Illumina Focus Panel est un essai de reséquençage ciblé pour l'analyse des biomarqueurs de 52 gènes dont la pertinence pour les tumeurs solides est connue. En utilisant le Focus Panel, les chercheurs peuvent analyser simultanément l'ADN et l'ARN. Les principales caractéristiques sont les suivantes :
Contenu des gènes pertinents
Ciblez les biomarqueurs de 52 gènes pertinents pour les tumeurs solides
Flux de travail rapide et rationalisé
Préparez des librairies prêtes pour le séquençage en une seule journée à partir de seulement 1 ng d'échantillons de haute qualité ou 10 ng d'échantillons fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE)
Données précises
Détection de mutations somatiques à une fréquence inférieure à 5 % grâce à une analyse locale ou basée sur le cloud
Le Focus Panel fait partie d'un flux de travail intégré qui comprend la préparation de librairies AmpliSeq pour la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) d'Illumina, la technologie de séquençage par synthèse (SBS) de la prochaine génération (NGS) d'Illumina et l'analyse automatisée.
Ce panel prêt à l'emploi vous permet d'économiser le temps et les efforts nécessaires à l'identification des cibles, à la conception des amorces et à l'optimisation des panels.
Spécifications
Durée de l'essai - 5-6 heures (préparation de la librairie uniquement ; n'inclut pas la quantification de la librairie, la normalisation ou le temps de regroupement)
Type de cancer - Tumeur solide
Description - Recherche d'analyse somatique sur 52 gènes associés aux cancers des tumeurs solides.
Temps de travail - < 1.5 hr
Quantité d'entrée - 1-100 ng (10 ng recommandés par pool)
Nombre d'amplicons - 553 au total. 2 pools. (Pool ADN : 269 amplicons. Pool ARN : 284 amplicons.)
Types d'échantillons spécialisés - Tissu FFPE
Classe de variants - polymorphismes nucléotidiques simples (SNP), fusions de gènes, variants somatiques, insertions-délétions (indels), variants du nombre de copies (CNV)
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