Le AmpliSeq for Illumina Cancer Hotspot Panel v2 est un essai de reséquençage ciblé pour la recherche de mutations somatiques dans les régions hotspot de 50 gènes ayant des associations connues avec le cancer, telles qu'identifiées dans la base de données du Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC)1. Les principales caractéristiques sont les suivantes
Contenu des gènes pertinents
Cible ~2800 mutations COSMIC de 50 oncogènes et gènes suppresseurs de tumeurs
Flux de travail rapide et rationalisé
Préparez des librairies prêtes pour le séquençage en une seule journée à partir de 1 ng d'échantillons de haute qualité ou de 10 ng d'échantillons fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE)
Données précises
Détecter les mutations somatiques jusqu'à une fréquence d'allèle variante de 5 % à l'aide d'une analyse locale ou basée sur le cloud
Le Cancer HotSpot Panel fait partie d'un flux de travail intégré qui comprend la préparation de librairies AmpliSeq pour la réaction en chaîne de la polymérase (PCR) d'Illumina, la technologie de séquençage par synthèse (SBS) de la prochaine génération (NGS) d'Illumina et l'analyse automatisée.
Ce panel permet une détection très sensible des variantes dans plusieurs types de cancer, notamment le cancer du poumon, du côlon, du sein, de l'ovaire, du mélanome et de la prostate. Ce panel prêt à l'emploi vous permet d'économiser le temps et les efforts nécessaires à l'identification des cibles, à la conception des amorces et à l'optimisation des panels.
Caractéristiques techniques
Durée de l'essai - 5 heures (préparation de la librairie uniquement ; n'inclut pas la quantification de la librairie, la normalisation ou le temps de regroupement)
Type de cancer - Pan-cancer, tumeur solide
Spécifications du contenu - Régions de points chauds de 50 gènes dont l'association avec le cancer est connue
Description - Recherche par analyse somatique sur les zones sensibles de 50 gènes liés au cancer.
Temps de travail - < 1.5 hr
Quantité d'entrée - 1-100 ng (10 ng recommandés par pool)
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