TargetPlex FFPE-Direct NGS 78-Gene Cancer Hotspot Panel - Primer Pool a été conçu pour cibler 78 gènes oncogènes ou suppresseurs de tumeurs avec un total de 378 amplicons dans trois pools d'amorces (5x). Les amorces sont conçues avec la technologie innovante de suppression du bruit TargetPlex pour améliorer l'efficacité du séquençage et la sensibilité de détection jusqu'à une fréquence allélique de 1 %. Ce produit ne contient que le pool d'amorces TargetPlex et nécessite le catalogue TargetPlex Library Prep Kit (compatible Illumina) ou le catalogue (compatible Ion Torrent) pour compléter la librairie.
Liste des gènes : ( )=nombre d'amplicons
AKT1 (1), AKT2 (1), AKT3 (3), ALK (7), APC (10), AR (2), ARAF (1), ARID1A (9), BAP1 (8), BRAF (3), BRCA1 (2), BRCA2 (2), CDH1 (4), CDK4 (1), CDKN2A (3), CSF1R (2), CTCF (8), CTNNB1 (1), DDR2 (1), ERBB3 (6), ERBB4 (5), ESR1 (4), FAT1 (2), FBXW7 (10), FGFR3 (5), FOXL2 (1), GATA3 (2), GNA11 (2), GNAQ (2), H3F3A (1), HIST1H3B (1), HNF1A (9), IDH1 (1), IDH2 (2), JAK2 (3), KDR (10), KEAP1 (1), KIT (15), KMT2C (2), KMT2D (4), KRAS (3), MAP2K1 (7), MAP2K2 (1), MAP3K1 (3), MLH1 (1), MTOR (4), NF1 (4), NFE2L2 (2), NOTCH1 (8), NRAS (4), PDGFRA (4), PIK3CA (11), PIK3R1 (8), POLE (2), PTEN (23), RAC1 (3), RB1 (5), RET (7), RHOA (3), ROS1 (2), SF3B1 (5), SMAD4 (7), SMARCB1 (4), SMO (4), SRC (1), STK11 (22), TP53 (23), TSC1 (1), TSC2 (2), U2AF1 (2), VHL (3)
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