L'une des considérations les plus importantes avant d'effectuer une électrophorèse sur gel 2D est le choix des tampons de solubilisation des protéines. Un tampon approprié doit solubiliser les protéines efficacement, sans perturber la charge native des protéines.
L'urée, un chaotrope commun, est largement utilisée pour la solubilisation et la dénaturation des protéines. L'un des inconvénients de l'utilisation de l'urée est la carbamylation. Dans l'eau, l'urée existe en équilibre avec le cyanate d'ammonium, dont le taux augmente avec la température et le pH. Le cyanate réagit avec les groupes α-amino et ε-amino des protéines et induit un changement du point isoélectrique des protéines. Cela conduit à des résultats artéfactuels. Par conséquent, la carbamylation doit être évitée
Une façon de minimiser le risque de carbamylation est de préparer les réactifs à base d'urée frais avant chaque utilisation. G-Biosciences a développé une série de tampons de solubilisation secs, à base d'urée, pré-mélangés et prêts à l'emploi. Il suffit d'ajouter un volume approprié du tampon de réhydratation fourni au tampon sec. Utilisez-le ensuite pour solubiliser les protéines, ce qui permet de gagner du temps et d'améliorer la qualité de l'électrophorèse sur gel IEF/2D (brevet en instance).
Les tampons d'extraction FOCUS™ sont également conçus pour être utilisés comme tampons de réhydratation pour les bandes IPG
Les FOCUS™ Extraction Buffers sont des concentrations optimisées expérimentalement d'agents critiques, tampons et stabilisants, notamment l'urée, la thiourée, le Nonidet® P-40, le CHAPS et les sulfobétaïnes. Les tampons d'extraction FOCUS™ sont conçus pour produire une extraction optimale des protéines et une meilleure résolution des taches pour l'analyse sur gel 2D.
---