les 2'-déoxy-2'-nucléosides fluorés adoptent une conformation de sucre de type ARN, probablement en raison de la forte électronégativité du fluor. En raison de cette conformation en sucre, les duplex d'ARN (forme A) sont généralement plus stables d'un point de vue thermodynamique que les duplex d'ADN (forme B). Comme prévu, l'ajout de résidus 2'-F-ARN aux oligodéoxynucléotides augmente progressivement la stabilité thermique de leurs duplex avec l'ARN. La stabilisation est additive à environ 2° par résidu. Ce chiffre est comparable à celui du 2'-OMe-ARN qui est d'environ 1,5° et à celui de l'ARN qui est de 1,1° par résidu. Entre-temps, la spécificité des paires de bases reste intacte.
les liaisons phosphodiester 2'-F-ARN ne sont pas résistantes à la nucléase, bien que les liaisons phosphorothioate correspondantes soient très résistantes. Les chercheurs conçoivent généralement des oligonucléotides antisens pour former des duplex avec l'ARN, qui sont ensuite des substrats de la RNase H. Les duplex 2'-F-ARN/ARN uniformément modifiés ne sont pas des substrats de la RNase H. Toutefois, il est facile de préparer des oligonucléotides chimériques 2'-F-ARN/ADN phosphorothioate qui présentent une liaison renforcée à la cible ARN, sont des substrats de la RNase H et sont très résistants à la nucléase.
Caractéristiques techniques
Chimie
Masse moléculaire/poids - 307,17
Stockage et stabilité
Condition de remise en suspension -
- Ajouter un volume approprié de tampon recommandé (se référer à la fiche technique) - Laisser le tube reposer quelques minutes - Vortexer le tube pendant 15 secondes
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