Kit de réactifs pour la recherche Omni-C™

NGS

Spécifications Réactions 8 Échantillons validés Cellules et tissus de mammifères Technique Hi-C Étiquetage Utilisation à des fins de recherche uniquement Application(s) Analyse de la conformation de la chromatine, SNP et détection des variantes structurelles Description du produit Le kit Dovetail™ Omni-C™ utilise une endonucléase indépendante de la séquence pour la digestion de la chromatine avant la ligature de proximité. Le kit Omni-C™ fournit tous les réactifs nécessaires pour effectuer les étapes de ligature de proximité sur des échantillons de mammifères avant la génération de la bibliothèque de l'ENG. Le kit est compatible avec le module de bibliothèque pour Illumina (Cat # 25004) de Dovetail™ et avec les kits de préparation de bibliothèque standard par paire de tiers pour le séquençage d'Illumina. Le kit Omni-C offre les principaux avantages suivants : La fragmentation de la chromatine indépendante de la séquence permet la détection des contacts de chromatine à l'échelle du génome (jusqu'à 20 % du génome est non couvert par des approches Hi-C basées sur les enzymes de restriction) Même la couverture du génome entier, similaire au séquençage par fusil de chasse, permet l'appel SNP, le phasage des chromosomes et la détection des variantes structurelles La réduction de la charge d'ordonnancement pour atteindre la profondeur de couverture souhaitée permet de gagner du temps et de l'argent Les bibliothèques Omni-C permettent la résolution des interactions chromatiniennes à l'échelle du génome Grâce à l'utilisation d'une endonucléase indépendante de la séquence pour la digestion de la chromatine, le kit Omni-C offre toutes les caractéristiques d'une approche Hi-C sans le biais de séquence inhérent aux approches Hi-C basées sur les enzymes de restriction. Par rapport aux approches basées sur l'enzyme de restriction Hi-C, l'Omni-C présente les avantages suivants : Chevauchement important avec les données générées par les approches basées sur les enzymes de restriction mais enrichies en lectures cis à longue portée