Kit de test de biologie cellulaire C01080002

de cellulespour séquençage

L'ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin), suivi d'un séquençage de nouvelle génération, est une technologie clé pour la cartographie de la chromatine accessible à l'échelle du génome. Cette technologie repose sur l'utilisation de la transposase Tn5 qui coupe la chromatine ouverte exposée et ligature simultanément des adaptateurs pour l'amplification et le séquençage ultérieurs. Les méthodes ATAC-seq vous permettent de : De mieux comprendre la régulation des gènes et les signatures de la chromatine ouverte Déterminer la position des nucléosomes à une résolution d'un seul nucléotide Découvrir l'occupation des facteurs de transcription (TF) Le kit ATAC-seq de Diagenode est basé sur un protocole hautement validé et optimisé pour 50 000 cellules par réaction. Le kit comprend les réactifs pour la lyse cellulaire et l'extraction des noyaux, la tagmentation et la purification de l'ADN ainsi que pour l'amplification de la librairie. Les index d'amorces pour le multiplexage ne sont pas inclus dans le kit et doivent être achetés séparément. Caractéristiques du kit ATAC-seq : Besoin en cellules : 50 000 cellules / rxn Protocole robuste avec une grande reproductibilité entre les réplicats et les expériences répétitives Capture facile et efficace de l'ADN après la réaction de marquage en utilisant les colonnes MicroChIP DiaPure de Diagenode (incluses) Étape supplémentaire de qPCR pour déterminer le nombre de cycles nécessaires à l'amplification de la bibliothèque : Evite la sur-amplification Permet une adaptation/flexibilité pour les échantillons plus difficiles à réussir avec la préparation de la librairie. Donne une indication précoce si l'expérience ne fonctionne pas (pas d'amplification par qPCR)