Le microscope confocal est un microscope d'observation à haute résolution par rapport aux microscopes optiques moyens. Il détecte un objet par des points et crée une image 2D en reliant les points.
Comme il est possible de construire des données en 3D, y compris des objets à surface rugueuse, il peut prendre une image de la couche superficielle en coupe transversale. Il est également possible d'observer l'imagerie en coupe transversale car il possède une résolution dans la direction Z.
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