Les normes de quantification de la bibliothèque NGS avec les amorces PCR (pour la plateforme illumina) ont été développées pour quantifier la concentration de la bibliothèque NGS pour la plateforme de séquençage illumina. Il se compose d'étalons de bibliothèque (six dilutions de 10 fois) et d'un mélange d'amorces.
La quantification de la bibliothèque NGS des molécules amplifiables est essentielle pour la qualité des données de séquençage. Une concentration adéquate de la librairie maximisera la capacité de séquençage. Une mauvaise concentration de la librairie se traduit par une densité de grappes faible ou élevée sur la cellule d'écoulement, ce qui peut entraîner une faible capacité de séquençage.
La mesure de la concentration de la librairie NGS à l'aide de méthodes standard de quantification de l'ADN, telles que le spectrophotomètre ou le fluorimètre, n'est pas précise. La QPCR est le meilleur moyen de quantifier la librairie avec une grande cohérence et reproductibilité de la quantification de la librairie.
Notre réactif est une quantification très sensible, basée sur la PCR en temps réel, spécialement conçue pour les librairies NGS utilisant la plateforme de séquençage illumina. L'amplification utilise les séquences adaptatrices d'illumina comme amorces, et seules les bibliothèques entièrement liées à l'adaptateur seront amplifiées. Par conséquent, le réactif fournit une estimation précise de la concentration de la librairie basée sur les librairies illumina réellement séquençables. En outre, ce kit peut également être utilisé pour confirmer la réaction de ligature après la préparation de la librairie.
Nos normes de quantification des librairies sont compatibles avec les réactifs QPCR commerciaux à base de SYBR Green. Cela rend le kit plus flexible pour les scientifiques qui veulent utiliser leur réactif PCR en temps réel. La quantification de la concentration de la bibliothèque est réalisée par comparaison avec une courbe standard générée à partir des étalons de bibliothèque.
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