Le NGS Single Stranded DNA Library Prep Kit (plateforme illumina) a été développé pour la construction de librairies de haute qualité en utilisant de l'ADN simple brin cisaillé (50 ng - 500 ng) comme intrant. Ce kit est idéal pour créer des bibliothèques NGS à partir d'échantillons d'ADN dénaturé, d'ADN viral, d'ADN ancien hautement dégradé et d'autres ADN monocaténaire. Le flux de travail du kit ssDNA est simple : il suffit de préparer les librairies en deux étapes, suivies des étapes de PCR et de nettoyage. Les librairies sont prêtes en 1,5 heure seulement, avec un temps de travail de 10 minutes. Le regroupement des librairies est possible en fonction du type d'index. La librairie finale est spécifique à chaque brin.
Trois types d'index sont disponibles pour le kit :
Non-index : les librairies n'ont pas d'index.
Index : Chacune des amorces d'index possède une séquence d'index unique de 6 bases qui peut être utilisée pour identifier les bibliothèques. Le multiplexage des bibliothèques d'ADN ss est possible jusqu'à 48 échantillons. Les informations relatives à l'index peuvent être téléchargées ici.
Double index unique : le multiplexage d'échantillons d'ADN ss jusqu'à 96 librairies est possible grâce à des doubles index uniques. Nous avons développé un système d'index de différence à quatre bases. Ce système permet de générer des index avec au moins 4 bases différentes les unes des autres dans la longueur de l'index de 8 bases. Les amorces uniques d'indexation double éliminent les erreurs NGS (par exemple : erreurs de démultiplexage, mauvaise affectation des lectures, saut d'index, etc.) Les informations sur les index peuvent être téléchargées ici.
Avantages du kit :
Protocole simple et rapide
Rapide : la durée totale du protocole est de seulement 1,5 heure
Simple : Temps d'intervention de seulement 10 minutes
Procédure facile basée sur :
Le mélange maître prêt à l'emploi : Facilite la mise en place de la réaction
Moins de composants de réaction : Simplifie la préparation de la réaction
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