Le kit de préparation de bibliothèque d'ADN NGS sans PCR a été développé pour la construction de bibliothèques d'ADN pour le séquençage de nouvelle génération (plateforme illumina). Le kit ajoute des adaptateurs de bibliothèque 3′-dT-tailed aux deux extrémités des fragments d'ADN de manière efficace. Le kit utilise des fragments d'ADN double brin (émoussés et/ou collants) comme ADN d'entrée pour la construction de bibliothèques NGS, et est compatible avec les fragments d'ADN générés à la fois par des méthodes enzymatiques (enzymes de fragmentation de l'ADN BioDynami, etc.) et des méthodes physiques (sonication, nébulisation, etc.)
L'amplification par PCR est une étape standard pour la préparation des librairies de séquençage de nouvelle génération. La PCR est utilisée pour amplifier des fragments d'ADN entièrement ligaturés et pour ajouter des informations d'indexation aux bibliothèques. L'indexation permet de regrouper les échantillons de la bibliothèque afin de réduire le coût du séquençage.
Cependant, la PCR introduit une amplification inégale de l'ADN dans certaines régions d'ADN présentant des contenus GC et des structures secondaires extrêmes. Ce biais peut entraîner une couverture de séquençage très faible dans ces régions. Le séquençage de l'ADN dans ces régions reste un défi de taille.
La préparation de librairies sans PCR peut réduire le biais de la librairie et minimiser les lacunes de séquençage. Les données de séquençage provenant d'échantillons de librairies sans PCR ont une couverture génomique uniforme avec peu de lacunes et une meilleure profondeur dans les régions riches en GC. Notre kit NGS sans PCR offre une couverture optimale dans les régions traditionnellement difficiles, telles que les régions à forte teneur en GC, les régions à faible teneur en GC et les régions de séquences répétitives.
Deux types d'index sont disponibles pour le kit :
Non-index : Les bibliothèques n'ont pas d'index.
Index : Chaque bibliothèque contient un index i5 et un index i7. Le multiplexage des bibliothèques est possible jusqu'à 96 échantillons. La liste des index peut être téléchargée ici.
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