Le kit de préparation de librairies ChIP-Seq (plateforme illumina et MGI) a été développé pour la construction de librairies ChIP-Seq de haute qualité en utilisant 5 ng à 400 ng d'ADN ChIP en entrée. Le kit est compatible avec les fragments d'ADN de ChIP générés par des méthodes enzymatiques et physiques (sonication, nébulisation, etc.).
ChIP-Seq est la combinaison de l'immunoprécipitation de la chromatine (ChIP) et du séquençage de nouvelle génération. Il s'agit d'un outil puissant pour l'analyse des facteurs de transcription globaux et d'autres protéines dans les maladies et les voies biologiques, ainsi que pour la caractérisation des modifications des histones à l'échelle du génome à une résolution d'une seule base. La technique ChIP-Seq permet d'établir le profil fonctionnel des facteurs de transcription globaux au niveau du génome entier et de mieux comprendre les modifications épigénétiques.
Trois types d'index sont disponibles pour le kit de préparation de librairies ChIP-Seq de la plateforme illumina :
Non-index : les librairies n'ont pas d'index.
Index : chaque amorce d'index contient une séquence d'index unique de 6 bases qui peut être utilisée pour l'identification. 48 échantillons peuvent être regroupés. Les informations sur l'index peuvent être téléchargées ici.
Index double unique : Le multiplexage de la librairie ChIP-Seq pour 96 échantillons est possible. Notre système unique d'indexation par différence de 4 bases a une longueur d'index de 8 bases et au moins 4 bases sont différentes l'une de l'autre pour une meilleure identification de la librairie. Nos amorces uniques à double indexation éliminent les erreurs de séquençage telles que le saut d'index, la contamination d'index, la mauvaise assignation et d'autres erreurs. Les informations sur les index peuvent être téléchargées ici.
Des index sont disponibles pour les kits de la plateforme MGI.
Avantages du kit :
Protocole très rapide
La préparation de la librairie peut être effectuée en 1,5 heure
Le temps de mise en œuvre est d'environ 10 minutes seulement
---