Le kit NGS FFPE DNA Library Prep (plateformes illumina et MGI) a été développé pour la construction de librairies d'ADN FFPE de haute qualité en utilisant 10 ng à 400 ng d'ADN d'entrée isolé à partir d'échantillons fixés au formol et inclus dans la paraffine (FFPE). Les dommages causés à l'ADN par la fixation rendent difficile la construction de bibliothèques de haute qualité. Notre kit a été optimisé pour réparer l'ADN endommagé dans les réactions. Le multiplexage de la bibliothèque d'ADN FFPE NGS est possible.
Les échantillons FFPE constituent une ressource précieuse pour la recherche biomédicale. Cependant, les méthodes de fixation et les conditions de stockage endommagent considérablement l'ADN des échantillons. L'extraction d'un ADN de haute qualité à partir d'échantillons FFPE est donc souvent un défi. Le faible rendement et la mauvaise qualité de l'ADN FFPE sont généralement courants en raison du nombre limité de tissus et de la dégradation de l'ADN.
Par conséquent, il est généralement difficile de construire des librairies NGS de haute qualité à partir d'une faible quantité et d'une faible qualité d'ADN FFPE. Pour résoudre ce problème, nous avons mis au point le kit de préparation de librairies NGS d'ADN FFPE, qui permet de créer des librairies de haute qualité à partir d'échantillons d'ADN FFPE de faible quantité.
Trois types d'index sont disponibles pour le kit NGS FFPE DNA Library Prep de la plateforme illumina :
Non-index : les librairies n'ont pas d'index.
Index : Chacune de nos amorces d'index contient un code-barres ADN unique (6 bases de long) qui peut être utilisé pour identifier une bibliothèque individuelle. Le multiplexage des librairies est possible jusqu'à 48 échantillons. Les informations sur l'index peuvent être téléchargées ici.
Double index unique : Le multiplexage des bibliothèques d'ADN FFPE est possible avec 96 échantillons grâce au système unique d'indexation double.
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