détection qualitative de l'ARN du virus 2019 dans les échantillons des voies respiratoires supérieures (extraits nasopharyngés et oropharyngés) au moyen de systèmes PCR en temps réel
(extraits nasopharyngés et oropharyngés) par des systèmes PCR en temps réel. Elle est considérée comme une aide au diagnostic de l'infection par le virus 2019.
2. Principe de la RT-PCR en temps réel
Le principe de la détection en temps réel est basé sur le dosage de la 5'nucléase fluorogénique. Au cours de la réaction PCR, l'ADN polymérase
clive la sonde à l'extrémité 5' et sépare le colorant rapporteur du colorant extincteur uniquement lorsque la sonde s'hybride à l'ADN cible.
Ce clivage est à l'origine du signal fluorescent généré par le colorant rapporteur clivé, qui est contrôlé en temps réel par le système de détection de la PCR. Le cycle PCR au cours duquel une augmentation du signal de fluorescence est détectée initialement (Ct) est proportionnel à la quantité du produit PCR spécifique. Le contrôle des intensités de fluorescence en temps réel permet de détecter l'accumulation du produit sans avoir à rouvrir le tube de réaction après l'amplification.
---