Calprotectin devient disponible dans le lumen intestinal par l'intermédiaire du rejet de leucocyte, de la sécrétion active, de la perturbation de cellules et de la mort cellulaire. Ceci a comme conséquence les niveaux fécaux élevés de calprotectin, qui peuvent être détectés dans le tabouret. Les niveaux fécaux élevés de calprotectin indiquent donc l'inflammation intestinale. Les gens avec les maladies intestinales inflammatoires actives (IBDs) comme, colite ulcéreuse ou maladie de Crohn ont autant qu'une augmentation de 10 fois des niveaux fécaux de calprotectin et de la mesure du calprotectin peut servir d'essai biochimique à ces maladies.
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